项目简介

CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是一种高效研究蛋白质 -DNA 相互作用的高分辨率表观遗传学技术。其原理基于 靶向性染色质切割与标记：首先通过抗体特异性识别目标蛋白（如组 蛋白修饰或转录因子），引导 Tn5 转座酶在结合位点附近切割 DNA 并 插入测序接头，随后对片段化 DNA 进行扩增测序，从而精准定位蛋白 结合或修饰的基因组区域。该技术具有样本需求量少（可低至单个细 胞）、信噪比高、实验周期短的优势，广泛应用于绘制组蛋白修饰图谱（如 H3K4me3、H3K27ac）、解析转录因子调控网络（如干细胞多能性因 子 OCT4、SOX2）、揭示疾病相关染色质状态变化（如癌症异常增强 子激活）以及联合多组学探究基因表达的表观遗传调控机制。

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研究案例

      代谢重编程和表观遗传改变对胰腺导管腺癌（PDAC）的侵袭性有所贡 献。乳酸依赖的组蛋白修饰是一种新型的组蛋白标记，它将糖酵解代 谢产物与乳酸化修饰的表观遗传过程联系起来。然而，组蛋白乳酸化 在 PDAC 中的作用尚不清楚。特别是在 PDAC 中，组蛋白乳酸化水平， 尤其是 H3K18la 水平升高，且 H3K18la 高水平与预后不良相关。通过 不同种类的抑制剂抑制糖酵解活性或 LDHA 的敲低，在体外和体内都 对 PDAC 的抗肿瘤效果有所贡献。E1A 结合蛋白 p300（P300）和组 蛋白去乙酰化酶 2 分别是 PDAC 细胞中组蛋白乳酸化的潜在修饰酶和 擦除酶。H3K18la 在启动子区域富集并激活了有丝分裂检查点调节因 子 TTK 和 BUB1B 的转录。有趣的是，TTK 和 BUB1B 可以提高 P300 的表达，进而增加糖酵解。此外，TTK 在酪氨酸 239（Y239）位点磷 酸化 LDHA 并激活 LDHA，随后上调乳酸和 H3K18la 水平。