项目简介

在基因表达调控研究中，解析转录因子与染色质的相互作用至关重要。ATAC-seq可以识别开放染色质区域，但无法直接鉴定与之结合的蛋白质复合物。表观生物隆重推出ATAC-MS（染色质开放性质谱检测）服务，ATAC-MS突破ATAC-seq的局限，可直接鉴定结合在开放染色质上的转录蛋白质复合物[1]。 

ATAC-MS通过生物素修饰接头的高活性Tn5转座酶插入开放染色质区域上DNA，用链霉亲和素偶联的磁珠与生物素反应，富集复合物之后收集蛋白即可进行质谱，可直接鉴定蛋白质，精确量化蛋白质丰度，揭示转录调控的动态变化和机制。ATAC-MS也可配合ATAC-seq，联合分析结合的转录调控复合物和开放染色质区域基因组信息。

技术原理

通过生物素修饰接头的高活性Tn5转座酶插入开放染色质区域上DNA，用链霉亲和素偶联的磁珠与生物素反应，富集DNA及DNA上结合的转录蛋白复合物，对复合物进行蛋白质酶解-肽段纯化后进行质谱分析（富集DNA也可用于构建DNA文库，并行ATAC-seq）[1]。 

技术优势

1. 对低丰度的转录因子具有高灵敏度 

2. 可直接鉴定开放染色质区域的转录蛋白复合物 

3. 可与ATAC-seq、RNA-seq联合分析，同时获取开放染色质的基因组位置、DNA结合蛋白和转录复合位点的相互作用信息，全面解析DNA-转录蛋白机制