项目简介
RNA 甲基化指发生在RNA分子上不同位置的甲基化修饰现象,常见的RNA转录后修饰方式有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)和5甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C)等。最新研究发现,m6A修饰在调控基因表达、剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA译等方面扮演重要角色,因此meRIP-seq助力解决细胞分化,生物发育、疾病发生发展,热休克反应等生物学问题。本公司开发的微量meRIP-seq技术,通过技术优化,大幅降低meRIP的样本要求量,500ng-20ug 总RNA即可满足实验要求。利用最新的去rRNA技术,可以同时检测mRNA, lncRNA及环状RNA的甲基化修饰谱,帮助研究人员对RNA转录后甲基化修饰图谱进行全面研究,是表观转录组学研究的关键技术。
技术原理
通过生物素修饰接头的高活性Tn5转座酶插入开放染色质区域上DNA,用链霉亲和素偶联的磁珠与生物素反应,富集DNA及DNA上结合的转录蛋白复合物,对复合物进行蛋白质酶解-肽段纯化后进行质谱分析(富集DNA也可用于构建DNA文库,并行ATAC-seq)[1]。
技术优势
1. 对低丰度的转录因子具有高灵敏度
2. 可直接鉴定开放染色质区域的转录蛋白复合物
3. 可与ATAC-seq、RNA-seq联合分析,同时获取开放染色质的基因组位置、DNA结合蛋白和转录复合位点的相互作用信息,全面解析DNA-转录蛋白机制
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